La función de la Comisión de valoración y selección es el estudio de las series documentales que produce la Diputación. Define los valores legales, jurídicos, fiscales, históricos, científicos o culturales de los documentos y determina su conservación permanente o temporal, o su eliminación.
La Comisión está compuesta por el Secretario General o persona experta en Derecho Administrativo en quien delegue, el Director del Archivo, un representante de la oficina de productora de la documentación que en ese momento se esté valorando y un experto en Historia Contemporánea. Dicha Comisión está presidida por el diputado de Régimen interior.